Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Evrimsel Analiz (2017): Feeman,S and Herron, J.C, (4. baskıdan çeviri), Palme yayınevi
Evrim (2008) Futuyma, D.J. , Palme yayınevi
Lemey, P., Salemi, M., ve Vandamme, A. M. (Eds.). (2009).The phylogenetic handbook: a practical approach to phylogenetic analysis and hypothesis testing. Cambridge University Press
Dersin İçeriği
Ders kapsamında, filogenetik çıkaraımları anlamlandırmak için öncelikli olarak sistematik, sınıflandırma ve taksonomi gibi temel kavramlara ait bilgiler verilecek, sonrasında amino asit ve DNA dizilerinde meydana gelen evrimsel değişiklikler ve baz değişim modelleri gibi temel moleküler kavramlar açıklanacaktır. Güncel filogenetik ağaç oluşturma metotları (uzaklık temelli, parsimoni temelli ve olasılık temelli yaklaşımlar) karşılaştırmalı olarak verilecek, moleküler saat kavramı üzerinde durulacaktır. Farklı taksonlara ait organizmalar kullanılarak moleküler veri setleri oluşturulacak ve in silico filogenetik çıkarımlar gerçekleştirilecektir.
Dersin Amacı
Türlerin benzerlik ve farklılık düzeylerini ölçmek ve onların evrimsel geçmişlerini anlamak için öğrencilere moleküler ve morfolojik verileri uygun belirteçler, örneklem büyüklükleri ve ağaç oluşturma metotları kullanarak analiz edebilme becerisinin kazandırılmasını sağlamaktır.
