Yıl: 2024, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Handbook of New Bacterial Systematics. Edt: M. Goodfellow and A.G. O'Donnell, Academic Press, London, 1993. Applied Microbial Systematics, Priest F G. and Goodfellow, Kluwer Academic Publishers, 2000.
Dersin İçeriği
Bakteri sistematiğinde temel kurallar, bakterilerin sistematikteki tarihsel yeri, biyolojik ve prokaryotik tür kavramı. İzolasyon, identifikasyon ve klasifikasyon. Test organizmalarının izolasyonu ve gruplandırılması, Genomik DNA izolasyonu. 16S rRNA gen bölgesinin PCR amplifikasyonu. 16S rRNA sekansı ve filogenetik analizler. Akraba tip türlerinin seçimi. Fenotipik testlerin belirlenmesi ve uygulanması. Kemotaksonomik analizler. Yağ asiti ekstraksiyonu ve analizi. Mikolik asit ekstraksiyonu ve analizi. Menakinonların izolasyonu ve analizi. Şeker izolasyonu ve analizi. Lipidlerin izolasyonu ve analizi. DNA-DNA hibridizasyonu. Houskiping genler ve önemi. Test sonuçlarının değerlendirilmesi.
Dersin Amacı
Prokaryotik tür tanımını kavramak, Prokaryotik sistematiğn esaslarını anlamak, farklı alanlardan elde edilen verileri analiz ederek bir izolatı geçerli taksonlara yerleştirebilmenin esaslarını öğrenmek.
