Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Doç. Dr. Ali Osman Adıgüzel Doç. Dr. Sadık Demirtaş *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2024, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Metagenomics, Methods and Protocols, Second Edition Edited by Wolfgang R. Streit and Rolf Daniel, Humana Press, 2017.

Dersin İçeriği

Metagenomiğin tanımı ve kullanım alanlarının açıklanması. Toprak, su, katı yüzeyler gibi farklı habitatlardan DNA ve RNA ların izolasyon yöntemlerinin öğrenilmesi, metagenomik kütüphanelerin hazırlanması, gen temelli mikrobiyal çeşitliliğin belirlenmesi, metagenomik kütüphanelerden fonksiyonel proteinlerin taranması, ve ifade edilmesi.

Dersin Amacı

Kültüvasyonları mümkün olmayan ya da henüz kültüve edilmemiş organizmalardaki genetik potansiyelin ekolojik ve biyoteknolojik çalışmalar için araştırılmasında kilit bir teknoloji olan metagenomiğin kavranması ve metagenomik çalışmalarda kullanılan metodların incelenmesi.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Metagenomiks ve ekosistem biyolojisi: Kavramsal çerçeveler, araç ve yöntemler.
2 Metagenomiğin ötesi: Mikrobiyal komünitelerin çalışılmasında tamamlayıcı yaklaşımların birleştirilmesi
3 Prokaryotik mikrobiyal komünitelerde horizontal gen transferi
4 Kompleks mikrobiyal komünitelerin metagenomik tarama ile analizi
5 Dünya çapında metagenomik veri altyapısının kurulması için açık veri kaynakları
6 Bitki-mikrop etkileşimlerinin metagenomik metotlarla araştırılma potansiyeli
7 Metagenomiksin biyoremediasyona uygulanması
8 Biyoürünler için metagenomiks uygulamaları I
9 Arasınav
10 Biyoürünler için metagenomiks uygulamaları II
11 Yeni genlerin biyolojik araştırılması
12 Yeni kavramların keşfi
13 Metagenomiks ve insan mikrobiyomu çalışmalarındaki uygulamaları I
14 Metagenomiks ve insan mikrobiyomu çalışmalarındaki uygulamaları II
15 Metagenomiksdeki felsefi temalar