Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Prof. Dr. Kubilay Yıldırım Dr. Öğr. Üyesi Hayrettin Saygın *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2024, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Chemical Methods in Prokaryotic Systematics. 403p. Goodfellow, M. and O'Donnell A. John Wiley & Sons Ltd. 1994. Applied Microbial Systematics, Priest F G. and Goodfellow, Kluwer Academic Publishers, 2000.

Dersin İçeriği

Kemosistematik, tanımı ve bakteri sistemayiğindeki yeri. Yağ asitlerinin izolasyonu ve analizleri. Mikolik asit izolasyonu. Mikolik asitlerin TLC analizleri, Mikolik asitlerin HPLC analizleri. Şekerlerin izolasyonu ve TLC analizleri. Menaquinon izolasyonu, TLC saflaştırması ve GC analizleri. Ubukinon izolasyonu, TLC saflaştırması ve GC analizleri. Lipid ekstraksiyonu ve TLC analizleri. Murein tabakasının kimyasal kompozisyonu ve taksonomik marker olarak kullanılması. Bakteriyal sistematikte pirolizis kütle spektrometrisi.

Dersin Amacı

Bakteri hücre bileşenlerini izole etmek ve tanımlamak. Bunları moder bakteri sistematiğinde kemotaksonomik markör olarak kullanmayı öğrenmek amaçlanmaktadır.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Polifazik taksonominin tarihçesi ve temel ilkeleri
2 Bakteri sınıflandırmasında kullanılan fenotipik, genotipik ve kemotaksonomik kriterler
3 Kemotaksonominin tanımı ve önemi
4 Hücre duvarı bileşenleri: Peptidoglikan ve türevleri
5 Hücre zarındaki polar lipidlerin yapısı ve taksonomik önemi
6 İzosoprenoid kuinonlar (menaquinon, ubiquinon) ve taksonomik rolü
7 Hücre içi yağ asitleri ve FAME analizi
8 Ekstraksiyon teknikleri: Kuinon, lipid ve yağ asitlerinin hazırlanması
9 TLC (İnce Tabaka Kromatografisi) uygulamaları
10 GC (Gaz Kromatografisi) ile kemotaksonomik analizler
11 HPLC (Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografisi) ile kuinon analizi
12 Kemotaksonomik verilerin yorumlanması ve veri standardizasyonu
13 Kemotaksonomik verilerin polifazik sınıflandırma sistemlerine entegrasyonu
14 Vaka çalışması: Bir izolatın polifazik sınıflandırması
15 Öğrenci sunumları ve güncel araştırmaların değerlendirilmesi