Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Yrd.Doç.Dr. Kemal Bilgin *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Farklı bir isim yazıyor veya boş geliyor ise; ubs.omu.edu.tr adresinden, Öğrenci Web (Öğretim Üyesi) modülü seçilmeli,
  • Bologna Süreci -> Ders Öğretim Planları seçilmeli,
  • Açılan pencerede, ders verdiğiniz Fakülte, Bölüm, Ders seçilerek, Öğretim Üyesi (Üyeleri) alanına isminizi yazmalısınız...
Yıl: 1, Dönem: 2
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

– Temizkan G, Arda N. (Eds) Moleküler Mikrobiyolojide Kullanılan Yöntemler. İÜ BİYOGEM No.2., Nobel Tıp Kitabevleri, 2004. – Durmaz R. (Ed) Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri, 2001. – Ağaçfidan A, Badur S, Türkoğlu S. (Eds) İnfeksiyon Hastalıklarının Tanısında Moleküler Yöntemler. TMC No: 42, 2002 – Vicente M, Tamares J, Valencia A, Mingorance J. (Eds) Molecules in Time and Space; Bacterial Shape, Division and Phylogeny. Kluwer Academic/Plenum Publishers, 2004. – Dale JW, Park SF, Molecular Genetics of Bacteria, Wiley, 2004. – Synder L, Champness W, Molecular Genetics of Bacteria, ASM Press, 2003. – Ogunseitan O. Microbial Diversity, Blackwell, 2005 – Decker J, Udo Reischl.(Eds.) Molecular Diagnosis of Infectious Diseases, Humana Press, 2004 – Riley LW. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases, Principles and Practices, ASM Press, 2004 – Thompson RCA. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases, Arnold, 2000. – Carrington M, Hoetzel AR, Molecular Epidemiology, The Practical Approach Series, OUP, 2002 – Hoetzel AR. Molecular Genetic Analysis of Populations, The Practical Approach Series, OUP, 1998 – McPherson MJ, et al. (Eds), PCR, The Practical Approach Series, OUP, 1991 – McPherson MJ, et al. (Eds), PCR 2, The Practical Approach Series, OUP, 1995 – Monaco AP. Pulsed Field Gel Electrophoresis, The Practical Approach Series, OUP, 1995 – van Belkum A, Duim B, Hays JP. (Eds) Experimental Approaches for Assessing Genetic Diversity Among Microbial Pathogens, WET, 2003. – Dijkshoorn L, Towner KJ, Struelens M (Eds), New Approaches for the Generation and Analysis of Microbial Typing Data, Elsevier, 2003. – Fraser CM, Read TD, Nelson KE.(Eds), Microbial Genomes, Humana Press, 2004. – Woodford N, Johnson AP. (Eds), Genomics, Proteomics and Clinical Bacteriology, Humana Press, 2004. – Sambrook J, Russell DW (Eds), Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 2001. – Primrose SB, Twyman RM, Old RW. Principles of Gene Manipulation. Blackwell Sciences, 2004 – Primrose SB, Twyman RM. Principles of Genome Analysis and Genomics. Blackwell Publishing, 2003. – Westhead DR, Parish JH, Twyman RM. Bioinformatics, Bios, 2002.

Dersin İçeriği

Evrimsel Ekoloji ve Dinamik, Mikrobiyal Genler: Yapı, Organizasyon ve İşlev, Mikrobiyal Genomda Modularite, Mikrobiyal Genomik, Mikrobiyal Popülasyon Dinamiği, Filogenomik

Dersin Amacı

Bu dersin, moleküler mikrobiyolojinin temelleri ve ilkelerine bir giriş olması amaçlanmıştır

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarının dizaynı
2 Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında çalışma prensipleri
3 Ekstraksiyon yöntemi
4 PCR içerik oluşturma
5 PCR optimizasyonu
6 PCR çeşitleri
7 PCR çeşitleri
8 Elektroforez prensipleri
9 PFGE uygulama
10 PFGE yorumlama
11 Dizileme yöntemi
12 Dizileme yöntemi
13 Mikroerrey yöntemi
14 Mikroerrey yöntemi

Değerlendirme

# Etkinlikler Adet Yuzde Katkısı Yarıyıl İci Etkinlik Yıl Sonu Etkinlik
90 Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 0 40
91 Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 0 60
1 Ara Sınav 1 100 1
2 Final Sınavı 1 100 1

Ders İş Yükü Verisi

# Etkinlikler Adet Süresi(saat) Toplam İş Yükü(saat)
1 Ara Sınav 1 1 1
2 Final Sınavı 1 1 1
5 Derse Katılım 14 1 14
32 Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma 14 5 70
33 Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma 14 5 70

Dersin Öğrenme Çıktıları

# Öğrenme Çıktı Id Açıklama
1 1477154 Moleküler yöntemlerin prensiplerini bilir.
2 1477155 Moleküler yöntemleri pratik olarak yapmayı bilir.
3 1477156 Moleküler yöntem sonuçlarını yorumlamayı bilir.
4 1477157 Yeni moleküler yöntemleri geliştirebilir.
5 1477158 Moleküler yöntemleri güvenle çalışabilir.

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama
1 74785 Tıbbi Mikrobiyoloji bilim alanında uzmanlık düzeyinde bilgi birikimine sahip olur
2 74786 Mikroskop kullanımı, mikroorganizmaların üretilmesi ve tanımlanması, temel bazı mikrobiyolojik testlerin yapılması konularında beceri sahibi olur
3 74783 Alanıyla ilgili teknolojik gelişmeleri takip eder, mesleki bilgilerini sürekli günceller.
4 74784 Temel Mikrobiyoloji bilgisine sahip olur
5 74787 Alanıyla ilgili teknolojik gelişmeleri takip eder, mesleki bilgilerini sürekli günceller.

Ögrenme Çıktı Matrisi

Program Çıktısı
1 2 3 4 5
Öğrenme Çıktısı
1 5 3 4 3 4
2 5 3 4 3 4
3 5 3 4 3 4
4 5 3 5 3 5
5 5 3 4 3 4
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek

İletişim Bilgileri

Adres:
Ondokuz Mayıs Üniversitesi Rektörlük Binası Kurupelit Kampüsü, 55139 Atakum / SAMSUN
Telefon:
(362) 312 19 19
Eposta:
iletisim@omu.edu.tr