Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Prof.Dr. Miray Sökmen *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Farklı bir isim yazıyor veya boş geliyor ise; ubs.omu.edu.tr adresinden, Öğrenci Web (Öğretim Üyesi) modülü seçilmeli,
  • Bologna Süreci -> Ders Öğretim Planları seçilmeli,
  • Açılan pencerede, ders verdiğiniz Fakülte, Bölüm, Ders seçilerek, Öğretim Üyesi (Üyeleri) alanına isminizi yazmalısınız...
Yıl: 1, Dönem: 1
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1. Molecular Plant Virology: Virus Structure and Assembly and Nucleic Acid-Protein Interactions (J.W. Davies) 2. Fundementals of Plant Virology (R.E.F. Matthews)

Dersin İçeriği

Bitki virüslerinin yapısal özellikleri, çift sarmal ve tek sarmal RNA ve DNA virüsleri, genomik organizasyonları, viroidler, satellit virüsler, virüs genlerinin fonksiyonları, virüs genlerinin klonlanması ve sekans analizleri, NCBI, Genbank ve diğer internet kaynaklarının kullanımı, bitki virüslerine dayanıklı transgenik bitkilerin elde edilmesinde viral yapılar

Dersin Amacı

Virüs genetiğinin ve virüslerin bitkideki enfeksiyonlarının moleküler düzeyde daha iyi anlaşılmasını sağlamak

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Bitki virüslerinin yapısal ve kimyasal özellikleri
2 Genomik özelliklerine göre virüsler (ssRNA, ssDNA, dsRNA ve dsDNa virüslerine örnekler)
3 Pozitif ve negatif duyarlı virüsler, ve ambisense özellikteki virüsler
4 Sub-viral etmenler (viroid, satellite RNA, satellite virus) ve özellikleri, hastalık oluşumundaki rolleri
5 Viral proteinler ve fonksiyonları
6 Virüs replikasyonunda konukçuya ait yapı ve molekülerin ve viral genlerin rolleri
7 Pozitif duyarlı tek sarmal ssRNA virüslerinde replikasyon (replikasyona model)
8 Ara sınav
9 Negatif duyarlı tek sarmal RNA virüslerinde ve çift sarmal RNA virüslerinde replikasyon
10 Tek sarmal DNA virüslerinde ve ters (reverse) transkripsiyon özelliğine sahip virüslerde replikasyon
11 Viral genlerin klonlanması ve baz dizilerinin elde edilmesi, NCBI (GENBANK)’a verilerin depolanması
12 Viral genomlarda mutasyon ve rekombinasyon, yeni virus streynlerinin oluşumundaki rolleri
13 Hatalı (defective) replikasyon ürünleri viral RNA'lar ve enfeksiyona etkileri
14 Virüse dayanıklı transgenik bitkilerin elde edilmesinde kullanılan viral yapılar

Değerlendirme

# Etkinlikler Adet Yuzde Katkısı Yarıyıl İci Etkinlik Yıl Sonu Etkinlik
90 Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 0 40
91 Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 0 60
1 Ara Sınav 1 60 1
28 Makale Kritik Etme 5 20 1
54 Ev Ödevi 4 20 1
2 Final Sınavı 1 100 1

Ders İş Yükü Verisi

# Etkinlikler Adet Süresi(saat) Toplam İş Yükü(saat)
1 Ara Sınav 1 1 1
2 Final Sınavı 1 2 2
11 Soru-Yanıt 9 3 27
28 Makale Kritik Etme 5 2 10
31 Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma 4 5 20
32 Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma 1 30 30
33 Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma 1 40 40
54 Ev Ödevi 4 5 20

Dersin Öğrenme Çıktıları

# Öğrenme Çıktı Id Açıklama
1 1407107 Virus kimyası ve fiziksel yapısı hakkında bilgi sahibidir,
2 1427939 Virus genom organizasyonu ve viral genlerin fonksiyonları konusunda bilgisi vardır,
3 1432635 Farklı taksonomik gruplardaki virüs türlerinde replikasyon olayını kavrar,
4 1412239 Genbankası veri tabanına nasıl ulaşacağını ve ham sekans verilerini nasıl depolayacağını bilir.
5 1538601 Filogenetik ağaç oluşturma ile ilgili programlar ve kullanımı hakkında bilgi sahibidir

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama
1 74396 Bitki patojenlerinin (fungus, virüs, bakteri vs.) özellikleri konusunda detaylı temel ve güncel bilgilere sahip olur ve oluşturdukları hastalıkları tanır.
2 74397 Tarım alanlarında sorun oluşturan yabancı otların morfolojik, biyolojik özellikleri ve zararları konusunda bilgiye sahip olur, yabancı otlar ile alternatif mücadele yöntemleri konusunda deneysel ve kuramsal özgün fikirler geliştirir.
3 74398 Tarım ve insanların yaşama alanlarında problem olan böcek, nematod, akar ve diğer zararlıları tanır, zarar şekillerini diğer biyotik ve abiyotik etkenlerin oluşturduğu zararlardan ayırır.
4 74399 Fungal ve bakteriyel hastalıklar, nematodlar, böcekler, akarlar ile kimyasal, biyolojik ve diğer alternatif mücadele yöntemleri konusunda bilgi sahibi olur.
5 74400 Bitki patojenlerinin, yabancı otların, böcek, nematod ve akar gibi zararlıların teşhis ve tanılanmasına yönelik geleneksel ve güncel laboratuvar yöntemlerini kendi alanında kullanır.
6 74401 Yabancı otların konvansiyonel ve moleküler düzeyde teşhisi, biyolojileri konusunda araştırma faaliyetleri yürütür.
7 74402 Böcek, nematod ve akarların laboratuvar şartlarında kitlesel üretimi için kullanılan yöntemleri uygular.
8 74403 Laboratuvar alet ve ekipmanlarını kullanır.
9 74404 Probleme yönelik hipotez geliştirir, bilimsel bir yaklaşım içerisinde laboratuvar, sera ve arazi şartlarında denemeler kurar.
10 74405 Deneme bulgularını yorumlar ve benzer çalışmaların sonuçları ile karşılaştırır.
11 74406 Bitki patojenlerini izole eder ve gerek in vitro gerekse in vivo şartlarda kültüre alır, biyolojik, moleküler, mikroskobik ve biyokimyasal yöntemler ile teşhis eder.
12 74407 Böcek, nematod, akar gibi bitki zararlılarını makroskobik ve mikroskobik teşhis kriterlerini kullanarak teşhis eder, laboratuvar ve arazi çalışmaları ile biyolojilerini izler.
13 74408 Bitki sağlığı ile ilgili olarak en uygun koruyucu ve tedavi edici yöntemleri seçer ve uygular.
14 74409 Bilimsel bir konudaki açıklamaları takip eder, plan yapar ve deneysel çalışmalar için sorumluluk alır.
15 74410 Bitkilerdeki biyotik ve abiyotik problemleri tanır, yorumlar ve çözer.
16 74411 Uzman olduğu alanda edindiği bilgileri kullanarak araştırma verilerini toplar ve analiz eder.
17 74412 Araştırma sonuçlarını lisansüstü tez olarak yazar ve bilimsel makale haline getir.
18 74413 Bireysel ve disiplinler arası çalışmaları planlama ve yürütme becerisi kazanır.
19 74414 Temel bilgisayar kullanımı ve yazılımlarını, bilişim ve iletişim teknolojilerini kendi alanında bilgiye erişme ve kaynak araştırması yapabilmek için verimli bir şekilde kullanır.
20 74415 Güncel mesleki konuları takip etmenin kariyerindeki önemini ve yaşamı boyunca “hayat boyu öğrenme” prensibini benimser.
21 74416 Uzman olduğu alandaki bilgisini ve fikirlerini, araştırma sonuçlarını sözlü ve yazılı değişik sunum teknikleri ile ifade eder, bilgi birikimini akademik ve tarımsal alanda çalışan kişilere ve öğrencilere aktarır.
22 74417 En az bir yabancı dil bilgisi ile kendi alanındaki bilgileri izleyebilir, bilimsel toplantıları takip edebilir ve birçok alandaki kişilerle iletişim kurar.
23 74418 Alanı ile ilgili konulardaki bilgilerin toplanması, analiz edilmesi, uygulanması ve duyurulması aşamasında bilimsel etik kurallarına göre hareket eder.
24 74419 Laboratuvar çalışmaları ve arazi uygulamalarında kullanılan malzeme ve ekipmanların kullanımından doğan olumsuzlukların azaltılması konusunda duyarlı olur.
25 74420 Doğal kaynakların korunması konusunda hassas, tarımsal uygulamaların çevresel ve küresel etkilerinin bilincindedir.
26 74421 Bitki patojenlerinin (fungus, virüs, bakteri vs.) özellikleri konusunda detaylı temel ve güncel bilgilere sahip olur ve oluşturdukları hastalıkları tanır.
27 74422 Tarım alanlarında sorun oluşturan yabancı otların morfolojik, biyolojik özellikleri ve zararları konusunda bilgiye sahip olur, yabancı otlar ile alternatif mücadele yöntemleri konusunda deneysel ve kuramsal özgün fikirler geliştirir.
28 74423 Tarım ve insanların yaşama alanlarında problem olan böcek, nematod, akar ve diğer zararlıları tanır, zarar şekillerini diğer biyotik ve abiyotik etkenlerin oluşturduğu zararlardan ayırır.
29 74424 Fungal ve bakteriyel hastalıklar, nematodlar, böcekler, akarlar ile kimyasal, biyolojik ve diğer alternatif mücadele yöntemleri konusunda bilgi sahibi olur.

Ögrenme Çıktı Matrisi

Program Çıktısı
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29
Öğrenme Çıktısı
1 5 3 4 2 4 3 5 4 5 4 3 4 5 5 4 5 3 4 5
2 5 4 5 3 4 3 5 4 5 4 3 4 5 5 4 5 3 4 5
3 5 2 4 1 4 3 5 4 5 4 3 4 5 5 4 5 3 4 5
4 5 3 4 1 5 3 5 4 5 4 3 5 5 5 4 5 3 4 5
5
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek

İletişim Bilgileri

Adres:
Ondokuz Mayıs Üniversitesi Rektörlük Binası Kurupelit Kampüsü, 55139 Atakum / SAMSUN
Telefon:
(362) 312 19 19
Eposta:
iletisim@omu.edu.tr