Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Doç. Dr. Aslıhan Kurt Kızıldoğan *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2023, Dönem: Bahar
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1.Brock Biology of Microorganism, 15. baskı, Pearson yayıncılık, Madigan, Bender, Buckley, Sattley, Stahl, 2019 2.Genomes 4; T.A. BROWN, Garland Sciences, 2018 3.Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction. 6th edition. By T.A. Brown. Published 2010 by Blackwell Publishing. https://app.jove.com/

Dersin İçeriği

Prokaryotik ve ökaryotik genomları, yapısal genomik, karşılaştırmalı genomik, fonksiyonel genomik, Metagenomik ve uygulamaları, fiziki ve genetik haritalama, Sanger dizileme, yeni nesil dizileme teknolojileri, transkriptom (RNA dizileme, mikroarray, RT-QPCR), proteomik, metabolomik. İntegrative -omik ve ve sistem biyolojisi ile ilişkisi. Omik teknolojisinde biyoinformatik yaklaşımlar.

Dersin Amacı

Sistem biyolojisini anlamak üzere canlıların genom içeriği, yapı ve işlevinin sahip olduğu transkriptom, proteom ve metabolom verileri ile ilişkilendirerek bütüncül bakış açısı elde edilmesi, bu bilimin biyoteknolojik bakış açısıyla uygulama alanlarını ortaya koymaktır.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Genom, Transkriptom, ve Proteom kavramlarına giriş-sistem biyolojisi ve biyoteknolojik önemi
2 DNA çalışmaları
3 Genom Haritalama
4 Sanger Dizileme
5 Yeni Nesil Dizileme (1. ve 2. Nesil)
6 Yeni Nesil Dizileme (3. ve 4. Nesil)
7 Genom Atıflandırma
8 Gen Fonksiyonlarını Belirleme
9 Ökaryotik Nüklear Genomlar
10 Prokaryot Genomları-Ökaryotik Organel Genomlar
11 Viral Genomlar ve Hareketli Genetik Elementler
12 DNA-Bağlama Proteinleri ve Gen İfadeleri
13 Transkriptom (RNA seq, mikroarray, RT-qPCR)
14 Proteom analizler
15 Metabolomik
16 Metagenomik