Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Doç. Dr. Samet Hasan Abacı *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2025, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Biyoinformatik Temelleri ve Uygulamaları. Kastamonu Üniversitesi Basımevi, Basım sayısı: 1, Sayfa Sayısı 322, ISBN:978-605-4697-19-9,

Dersin İçeriği

Genetikte istatistiksel analiz dersi, genetik verilerin temel kavramları ve istatistiksel yöntemlerle analizi üzerinde odaklanır. Veri ön işleme, özetleşme ve keşifsel analizle başlar; bertaraflar, eksik değerler ve görselleştirme ele alınır. Ardından genetik veride kullanılan temel testler (Ki-kare, Fisher, Hardy-Weinberg dengesi) ve ilişki modelleri (doğrusal ve lojistik regresyon, kovaryetler) öğrenilir. Varyans analizi ve çoklu genetik etkilerin incelenmesiyle çok değişken modelleri kurma pratiği yapılır; çoklu karşılaştırma düzeltmeleri ve doğrulama yöntemleri uygulanır. Popülasyon genetiği kavramları ve genom çapında ilişki çalışmaları (GWAS) kısa bir çerçevede ele alınır. Ayrıca veri görselleştirme, sonuç iletişimi, etik ve yeniden üretilebilirlik konuları nelere dikkat edilmesi gerektiğini kapsar.

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, genetik verilerin analizi için istatistiksel kavramları ve yöntemleri kavramsal ve uygulamalı olarak öğretmektir. Öğrenciler, genetik verileri temizleme, özetleme, hipotez testi, varyans analizi, regresyon, çoklu karşılaştırma düzeltmeleri ve temel popülasyon genetiği yöntemlerini kullanarak biyolojik soruları cevaplamayı öğrenirler.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Ders Tanıtımı ve Giriş
2 Genetik Verilerinin Özellikleri ve Temel Kavramlar
3 Genetik Veri Analizinde Kullanılacak Paket Programın Tanıtımı
4 Verilerin Paket Programda İşlenmesi, Tanımlayıcı İstatistikler, Ki kare Uyum İyiliği Testi
5 2 x 2 ve r x c seviyeli ki kare bağımsızlık testleri
6 Nominal Ölçekli İlişki Katsayıları
7 Sıralama Ölçekli İlişki Katsayıları
8 Nominal ve Aralık Ölçekli İişki Katsayıları
9 Vize Sınavı
10 Kappa, Risk ve MCNEMAR Testleri
11 Üç Yönlü Kontenjans Tabloları
12 Genom çapında ilişki çalışmaları (GWAS)
13 Genom çapında ilişki çalışmaları (GWAS)
14 K - Ortalamalar Kümeleme ve Hiyerarşik Kümeleme Analizi
15 Sınflama ve Regresyon Ağacı Analizi