Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Dr. Öğr. Üyesi Emek Aslan Doç. Dr. Aslıhan Kurt Kızıldoğan *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2023, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Biosynthesis of Secondary Metabolites - Second Edition R.B. Herbert, Springer; 2 edition (2006) Fermentation microbiology and biotechnology-3rd edition El-Mansi, Mansi Boca Raton, FL : Taylor & Francis/CRC Press, 2012. Metabolomics: Methods and protocols,  Wolfram Weckwerth,, Humana press 2007. Konu ile ilgili videolar https://app.jove.com/ https://app.jove.com/join-class?code=B224E0A1 Güncel makaleler

Dersin İçeriği

Mikrobiyal Biyoteknolojinin temelleri, tarihçesi ve uygulama alanları; biyoteknolojide kullanılan endüstriyel mikroorganizmalar ve biyoteknolojik ürünleri; Biyoteknolojide kullanılan moleküler mikrobiyal teknikler; omiks teknolojisi ve mikrobiyal biyoteknolojideki uygulamaları; Rumen mikrobiyomu; Biyosensörler ve çevresel uygulama alanları; Biyoyakıt üretimi ve araştırma olanakları; Biyoremediyasyon teknolojisinin çevresel uygulamaları; Biyomadencilik ve uygulama alanları; fermentör ve tipleri, bakteriyel polihidroksialkanatlar, PGPRler, ticari kimyasallar, THP üretimi, antibiyotik ve aşı üretimi, mikrobiyal pestisitler.

Dersin Amacı

Mikrobiyal Biyoteknoloji konusunda temel bilgiyi vermeyi, kullanılan güncel metot ve teknikleri tanıtmayı ve mikroorganizmaların, tarım, sağlık, enerji, biyo-güvenlik, ve çevre bilimiyle bağlantılı biyoteknolojik uygulamaları hakkında bilgi edinilmesini amaçlamıştır.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Mikrobiyal Biyoteknolojinin tarihçesi, kapsamı: kullanılan teknikler ve örnekler Mikrobiyal DNA izolasyonu
2 DNA, RNA, protein sentezi, Rekombinant DNA teknolojisi, klonlama, Prokaryot ve ökaryotlarda gen ifadesi ve manipülasyonu Plazmid DNA izolasyonu Plazmid DNA izolasyonu
3 Omiks dünyası: genomik, proteomik, transkriptomik, metagenomik, metabolomik Primer tasarımı Primer tasarımı
4 Suşların değerli metabolit üretimleri açısından izolasyonu ve taranması PCR PCR
5 Mikrobiyal üreme kinetikleri: kesikli ve sürekli kültür, fermantasyon teknolojisi, biypofilm, immobilize hücreler Bakteri kültürü hazırlama Bakteri kültürü hazırlama
6 PROTEİNLERİN REKOMBİNANT MİKROORGANİZMALAR TARAFINDAN BÜYÜK ÖLÇEKLİ ÜRETİMLERİ, PROTEİN MÜHENDİSLİĞİ, DİREKT MUTAGENEZ Gen klonlama-ligasyon Gen klonlama-ligasyon
7 Biyokatalizler: doğal enzimler ve varyantları Gen klonlama-transformasyon Gen klonlama-transformasyon
8 Mikroorganizmaların endüstriyel kullanımları: ticari ürünler, biyopolimerler, aminoasitler, etanol Klon tarama çalışmaları Klon tarama çalışmaları
9 BİYOREMEDİASYON, ATIK SU ARITIMI, AĞIR METALLERİN UZAKLAŞTIRILMASI, Rt-PCR RT-PCR
10 Biyomadencilik, biyoyakıtlar qRT-PCR qRT-PCR
11 PGPR’LER, mikrobiyal insektisitler, gut mikrobiyota
12 Antibiyotik ve aşı üretimi Biyoassay Biyoassay
13 Alternatif enerji üretimi
14 Mikrobiyal biyoteknoloji ve döngüsel ekonomi PET parçalama-PHA üretme