Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Dr. Öğr. Üyesi Hayrettin Saygın *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2025, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Evrimsel Analiz Kitabı (5. Baskı) Palme yayıncılık

Dersin İçeriği

Sistematiğe giriş, Filogenetik Sistematik, Evrimsel Sistematik ve Fenetik, Monofili, Parafili Ve Polifili Kavramları, Karakter ve karakter durumu çeşitleri: Homoloji ve analoji, Kladogram oluşturma yöntemleri: Henning ve Wagner Metotları, Kladogramlarla ilgli tanımlayıcı terimler, Kladogramlarla ilgili tanımlayıcı istatistikler, Optimalite kriterleri, Bakteri sistematiği hakkında genel bilgiler.

Dersin Amacı

Öğrencilere kladistik (Filogenetik Sistematik) analizin esaslarını öğretmek

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Filogenetik sistematiğe giriş, tarihsel gelişim
2 Sistematikte kullanılan temel kavramlar
3 Homoloji, analogi ve karakter evrimi
4 Karakter türleri ve karakter kodlama
5 Taksonomi ve kladistik arasındaki farklar
6 Parsimoni yöntemi
7 Maksimum olasılık yöntemi (Maximum Likelihood)
8 Bayesian filogenetik ve MCMC temelleri
9 Moleküler verilerin kullanımı ve hizalama
10 Morfolojik verilerin analizi ve kodlaması
11 Filogenetik ağaç okuma ve yorumlama
12 Bootstrap, destek değerleri ve güvenilirlik testleri
13 Güncel yazılımlar (MEGA, BEAST, MrBayes, PAUP) kullanımı
14 Filogenetik ağaçlarla sınıflandırma ve evrimsel yorumlama
15 Literatür sunumu ve uygulamalı analiz projesi