Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Prof. Dr. Münir Tunçer *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2025, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Tunçer M. (2022). Proteomik. Palme Yayıncılık. 418 sayfa. ISBN No: 978-605-282-876-2.

Dersin İçeriği

Öncelikle genomiğin proteomu oluşturmadaki önemi, genomik ve nükleik asit mikrodüzenlerinin proteomiğe etkisi ele alınmaktadır. Daha sonraki bölümlerde ise proteomik analizlerinin yapılmasında elektroforezi, kromatografi, mikrodüzenler ve MS tekniklerinin nasıl ve hangi araçlarla kullanıldığı üzerinde durulmaktadır. Son olarak ise proteomik uygulamaları kapsamında protein ifade profillerinin çıkartılması, protein-protein etkileşimlerinin ve protein komplekslerinin tanımlanması ve protein modifikasyonlarının haritalanması ele alınmaktadır.

Dersin Amacı

Proteinler ve proteomik ile ilgili teorik bilgilerin kavranması, proteomik analizlerinin yapılmasında elektroforezi, kromatografi, mikrodüzenler ve MS tekniklerinin nasıl ve hangi araçlarla kullanılacağının öğrenilmesi. Proteomikte MS verilerinin biyoinformatik araçları ile değerlendirilmesi ve verilerin kazılması.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 • Giriş
2 • Genomik ve nükleik asit mikrodüzenleri
3 • Proteomike genel bakış
4 • Analitik protein ve peptid ayrıştırma: Elektroforetik yöntemler
5 • Analitik protein ve peptid ayrıştırma: Kromatografik yöntemler
6 • Protein sindirim teknikleri
7 Protein miktarlarının belirlenmesi ve karşılaştırılması
8 • Protein tanımlama stratejileri
9 • Ara Sınav
10 • Protein mikrodüzenleri ve proteomik
11 • Protein ve peptid analizlari için kütle spektrometreleri
12 • Protein veri tabanları
13 • Peptid kütle parmakizi ve protein tanımlama
14 • Ardışık-MS ile peptid dizi analizi ve protein tanımlama
15 • Proteomların kazılması ve protein ifade profillerinin çıkartılması