Yıl: 2023, Dönem: Bahar
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, Edts: Stackebrandt E and Goodfellow M. John Wiley&Sons Ltd. 1991.
Applied Microbial Systematics, Priest F G. and Goodfellow, Kluwer Academic Publishers, 2000.
Handbook of New Bacterial Systematics. Edt: M. Goodfellow and A.G. O'Donnell, Academic Press, London, 1993.
Dersin İçeriği
Bakteri genomunun izolasyonu. Jel-elektroforez yöntemi ile görüntülenmesi, saflaştırılması. 16S r RNA gen bölgesi PCR amplifikasyonu. 16S rRNA gen bölgesi sekans analizi ve taksonomik marker olarak kullanımı. Ev sahibi (houskeeping) genlerin PCR amplifikasyonu, sekans analizleri. NRPS ve PKS antibiyotik genleri gibi biyoteknolojik önemi olan gen kümelerinin PCR amplifikasyonu, sekans analizleri. DNA parmak izlerinin bakteri sistematiğinde kullanımı. Proteinlerin ve enzimlerin bakteri sınıflamasında kullanımı, serolojik identifikasyon.
Dersin Amacı
Bakteri genomunda, 16S rRNA ve ev sahibi (houskiping) genler gibi bakteri sistematiğinde kullanılan genlerin PCR amplifikasyonlarını yapmak, sekans sonuçlarını analiz ederek filogenetik dendogramlarını oluşturmak ve yeni bir izolatın taksonomik hiyerarşisini belirlemeyi öğrenmek amaçlanmıştır
