1. Anasayfa

Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Prof. Dr. Yasemin Özdener Kömpe *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2025, Dönem: Güz
FBİ757., Moleküler Bakteri Sistematiği (mufredatId:6494, dersId: 31349, programId: 5069)
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, Edts: Stackebrandt E and Goodfellow M. John Wiley&Sons Ltd. 1991. Applied Microbial Systematics, Priest F G. and Goodfellow, Kluwer Academic Publishers, 2000. Handbook of New Bacterial Systematics. Edt: M. Goodfellow and A.G. O'Donnell, Academic Press, London, 1993.

Dersin İçeriği

Bakteri genomunun izolasyonu. Jel-elektroforez yöntemi ile görüntülenmesi, saflaştırılması. 16S r RNA gen bölgesi PCR amplifikasyonu. 16S rRNA gen bölgesi sekans analizi ve taksonomik marker olarak kullanımı. Ev sahibi (houskeeping) genlerin PCR amplifikasyonu, sekans analizleri. NRPS ve PKS antibiyotik genleri gibi biyoteknolojik önemi olan gen kümelerinin PCR amplifikasyonu, sekans analizleri. DNA parmak izlerinin bakteri sistematiğinde kullanımı. Proteinlerin ve enzimlerin bakteri sınıflamasında kullanımı, serolojik identifikasyon.

Dersin Amacı

Bakteri genomunda, 16S rRNA ve ev sahibi (houskiping) genler gibi bakteri sistematiğinde kullanılan genlerin PCR amplifikasyonlarını yapmak, sekans sonuçlarını analiz ederek filogenetik dendogramlarını oluşturmak ve yeni bir izolatın taksonomik hiyerarşisini belirlemeyi öğrenmek amaçlanmıştır

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Bakteriyal İzolatlar ve Biomaslarının Elde Edilmesi
2 Bakteri Genomunun İzolasyonu
3 Genomun Jel-elektroforez Yöntemi ile Görüntülenmesi ve Saflaştırılması.
4 PZR Amplifikasyonları İçin Optimizasyon Çalışmaları
5 Bakteri Sistematiğinde Evrensel Markör, 16S rRNA
6 16S rRNA Gen Bölgesi PZR Amplifikasyonu.
7 16S rRNA Gen Bölgesi Baz Dizi Analizi ve Taksonomik Markör Olarak Kullanımı.
8 Ev Sahibi genler ve Bu Genlerin PZR Amplifikasyonu, Bakteri Sistematiğindeki Yeri
9 Ara Sınav
10 Biyoteknolojik Önemi Olan Gen Kümeleri -NRPS ve PKS-I-II-III Antibiyotik Gen Kümeleri
11 Homoloji Çalışmaları ve Moleküler Sistematik-DNA-DNA, DNA-RNA, RNA-RNA
12 DNA Parmak İzlerinin Bakteri Sistematiğinde Kullanımı
13 Proteinlerin ve Enzimlerin Taksonomik Markör Olarak Önemi
14 Tüm Genom Analizleri ve Bakteriyal Taksonomik Önemi
15 Serolojik identifikasyon ve Bakteriyal Taksonomi