Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Doç. Dr. Aslıhan Kurt Kızıldoğan *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2023, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1. Brock Biology of Microorganism, 15. baskı, Pearson yayıncılık, Madigan, Bender, Buckley, Sattley, Stahl, 2019 2. Genomlar 3; 3. baskıdan çeviri, TA Brown, Çeviri editörleri Fevzi BArdakçı-Celal Ülger, Nobel yayıncılık,2015 3. An introduction to molecular Biotechnology, 2nd edition, Michael Wink, 2009, Wiley-Blackwell 4. Güncel makaleler

Dersin İçeriği

Mikrobiyal genomlar, metagenom, transkriptom, proteom, metabolom çalışmalarının temel prensiplerini ve Mikrobiyal Biyoteknoloji alanında uygulama alanlarını öğrenme, tarımda karşılaşılan sorunların giderilmesinde Tarımsal Biyoteknoloji konularında ürün geliştirmeye yardımcı deneysel kurguları oluşturabilme.

Dersin Amacı

Mikrobiyolojide -omik teknolojilerinin kullanımını ve uygulama alanlarının öğretilmesi amaçlanmaktadır.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Bakteri kromozom yapısı ve organizasyonu,
2 Ortolog genler, Horizontal gen transferi, gen duplikasyonu, minimal gen kümesi
3 Genomun fragmentasyonu ve haritalanması
4 Yeni nesil sekanslama yöntemleri
5 Gen annotasyonu, biyoinformatik analizler
6 Transkriptomik; gen fonksiyonu ve regülasyonunun belirlenmesi
7 Mikrodizi tekniği, mikroorganizmalarda uygulama alanları ve örnek çalışmalar
8 RNASeq tekniği, mikroorganizmalarda uygulama alanları ve örnek çalışmalar
9 Mikrobiyal proteom tanımı, kullanım amacı
10 Proteomik araçları: veritabanları-kütle spektrometrisi-yazılımlar-protein ayırma teknikleri
11 Proteomik uygulamaları: mining, protein ifade profili, protein network haritalama, protein modifikasyonlarının haritalanması
12 Metagenomik tanımı, amacı ve mikrobiyal uygulama alanları
13 Metagenomik: Bitki rizosferi, deniz suları ve hayvan mide içeriğinin örneklenmesi ve biyoteknolojik kazanımlar
14 Metabolomik: biyoteknolojik açıdan önemli mikrobiyal enzim ve metabolitlerin keşfi