Ders Notları

100% Complete (success)
Dikkat !!! Lütfen okuyunuz ...

Öğretim Üyesi (Üyeleri): Prof. Dr. Kubilay Yıldırım *

(*) Ders notu girebilmek için, bu alanda kendi isminiz yazıyor olmalı...

  • Bologna verilerinin girilmesi;
    ubys.omu.edu.tr adresinden,
    ÜBYS' de Öğretim Elemanları yetkisi seçilmeli... Öğretim elemanı danışmanlık işlemlerinden yapabilirsiniz...
Yıl: 2025, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Molecular Biology Techniques – Heather Miller, Sue Carson Principles and Techniques of Biochemistry and Molecular Biology – Wilson & Walker Molecular Cloning: A Laboratory Manual – Sambrook & Russell Güncel bilimsel yayınlar ve uygulamalı protokol kitapçıkları

Dersin İçeriği

Moleküler Analiz Teknikleri dersi, biyoteknoloji, moleküler biyoloji ve genetik alanlarında araştırma yapan öğrencilerin deneysel becerilerini geliştirmeyi amaçlamaktadır. Dersin başlangıcında, moleküler biyolojide yaygın olarak kullanılan analiz tekniklerine genel bir bakış sunularak, DNA, RNA ve protein gibi biyomoleküllerin hücreden izolasyon ve saflaştırma yöntemleri ele alınır. Bu moleküllerin saflık ve yoğunluklarının spektrofotometrik yöntemlerle değerlendirilmesi, agaroz jel elektroforezi gibi temel analiz teknikleriyle desteklenir. Daha sonra, nükleik asit çoğaltma yöntemlerinden Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR), gerçek zamanlı PCR (qPCR) ve ters transkripsiyon PCR (RT-PCR) tekniklerinin çalışma prensipleri, uygulamaları ve veri yorumlama yaklaşımları ayrıntılı şekilde işlenir. İzleyen haftalarda, genetik materyalin tespiti ve ekspresyon analizleri için kullanılan Southern, Northern ve Western blotlama yöntemleri öğretilir. Moleküler işaretleyiciler (RFLP, AFLP, SSR, SNP) ve bunların biyolojik çeşitliliğin belirlenmesindeki rolü ele alınır. DNA sekanslama tekniklerinden Sanger yöntemi ve yeni nesil dizileme (NGS) teknolojileri tanıtılarak genotipleme ve mutasyon analizi bağlamında örneklerle pekiştirilir. Protein analiz teknikleri kapsamında SDS-PAGE, 2D elektroforez ve proteomik yaklaşımlar değerlendirilir. Gen ekspresyonu analizlerinde mikroarray ve RNA-Seq gibi yüksek verimli teknolojilerle elde edilen verilerin analizi öğretilir. Dersin sonunda, moleküler tanı uygulamaları, laboratuvar güvenliği, kalite kontrol parametreleri ve veri yorumlama süreçleri tartışılır. Tüm konular teorik anlatımın yanı sıra laboratuvar uygulamalarıyla pekiştirilir.

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, moleküler biyoloji ve biyoteknoloji alanlarında kullanılan temel ve ileri düzey moleküler analiz tekniklerini öğretmek; bu tekniklerin ilkelerini, uygulama yöntemlerini ve sonuçların yorumlanmasını öğrencilere kazandırmaktır. Öğrencilerin hem teorik hem de uygulamalı beceriler kazanarak, laboratuvar araştırmalarında aktif rol alabilmeleri hedeflenmektedir.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Moleküler biyolojide kullanılan analiz tekniklerine genel bakış
2 Hücreden DNA, RNA ve protein izolasyonu yöntemleri
3 Nükleik asitlerin spektrofotometrik ve agaroz jel elektroforezi ile analizi
4 Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR): Temel prensipler ve çeşitleri
5 RT-PCR ve qPCR uygulamaları, veri analizi ve karşılaştırmaları
6 Southern, Northern ve Western blotlama teknikleri
7 Moleküler işaretleyiciler: RFLP, AFLP, SSR, SNP
8 Vize
9 DNA dizi analizi (Sanger ve NGS) ve genotipleme yöntemleri
10 Protein analizinde SDS-PAGE ve izoelektrik odaklama
11 Proteomik yaklaşımlar ve 2D elektroforez
12 Gen ekspresyonu analizleri: Mikroarray ve RNA-Seq
13 Moleküler tanı teknikleri (patogen tanımlama, mutasyon analizi)
14 Laboratuvar güvenliği ve kalite kontrol parametreleri
15 Uygulama örneklerinin değerlendirilmesi, rapor ve veri analizi