Yıl: 2025, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Biotechnology of Microbial Natural Products, Springer.
Natural Products: Discourse, Diversity, and Design, Wiley.
Secondary Metabolism in Microorganisms, Elsevier.
Metabolic Engineering ve Nature Chemical Biology dergilerinden seçilmiş makaleler.
BGC analizleri için antiSMASH, MIBiG, BiG-SCAPE gibi güncel çevrimiçi araçlar derste kullanılacaktır.
Dersin İçeriği
İkincil metabolit kavramı; mikroorganizmalarda ikincil metabolizmanın ekolojik rolleri; başlıca yapı sınıfları (poliketidler, nonribozomal peptitler, terpenoidler, alkaloidler); PKS ve NRPS biyosentez sistemleri; genom madenciliği ve BGC analizi; yeni metabolit keşif stratejileri; üretim regülasyonu; ikincil metabolit izolasyonu ve saflaştırma yöntemleri; kütle spektrometrisi ve NMR ile yapısal analiz; metabolik mühendislik ve sentetik biyoloji yaklaşımları; farmasötik, biyoteknolojik ve endüstriyel uygulamalar; güncel literatür tartışmaları.
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, mikroorganizmaların ürettiği ikincil metabolitlerin biyosentez yollarını, genetik düzenlenmelerini, ekolojik rollerini, yapısal çeşitliliğini ve biyoteknolojik uygulamalarını ileri düzeyde öğretmektir. Öğrencilerin genomik analizler, biyosentetik gen kümesi (BGC) incelemeleri, kimyasal karakterizasyon teknikleri ve metabolik mühendislik yaklaşımlarını kullanarak yeni ikincil metabolitlerin keşfi, biyokimyasal tanımlanması ve üretim optimizasyonu konusunda araştırma becerisi kazanmaları hedeflenmektedir.
