Yıl: 2025, Dönem: Güz
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria — Wiley.
Chemical Methods in Prokaryotic Systematics. 403p. Goodfellow, M. and O'Donnell A. John Wiley & Sons Ltd. 1994. <br />Applied Microbial Systematics, Priest F G. and Goodfellow, Kluwer Academic Publishers, 2000.
Dersin İçeriği
Fenotipik, genotipik, moleküler, kemotaksonomik ve filogenetik yöntemlerin polifazik sistematik çerçevesinde kullanımı; fenotipik karakterizasyon teknikleri; DNA-DNA hibritizasyonu, 16S rRNA analizi, ANI ve dDDH gibi genomik benzerlik ölçütleri; filogenetik ağaç oluşturma yöntemleri; peptidoglikan, polar lipit, kuinon ve yağ asidi analizleri; TLC, GC ve HPLC gibi kemotaksonomik teknikler; çoklu veri türlerinin entegrasyonu; polifazik sınıflandırma örnekleri ve güncel prokaryot taksonomisi araştırmaları.
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, prokaryot sistematiğinde kullanılan polifazik yaklaşımın teorik temelini, tarihsel gelişimini ve modern uygulamalarını ileri düzeyde öğretmektir. Fenotipik, kemotaksonomik, genotipik, filogenetik ve genomik veri türlerinin taksonomik değerlendirmedeki rollerini analiz etmek; prokaryotik izolatlardan elde edilen verileri bütüncül olarak yorumlamak; yeni izolatların sistematik konumlandırılması için gerekli bilimsel yöntemleri ve analitik yaklaşımları doktora düzeyinde kazandırmak hedeflenmektedir.
